Проблем в совместимости вообще нет. Просто так мозг сменить даже с перепиновками разъемов не получится: у мозгов на EJ15\16\18 ЭБУ и Юнит управления АКПП - это одно целое, так сказать два в одном. А у EJ20\25 (независимо от третей цифры - 201\202\203\204 и т.д.) ЭБУ и контроллер АКПП это абсолютно разные "приборы", соединенные между собой еще одной косичкой. Т.е. ход логики понятен? Придется еще и искать мозговину для КПП.
А ошибку вашу можно исправить, проехавшись на машине с человеком, который может по показаниям сенсоров сказать о состоянии сенсоров. Ошибка данная - Air intake system - говорит о неполадках во впуске. Причин может быть много от МАПа и КХХ, до Вакуумного усилителя тормозной системы.