После скидывания клемм на продолжительное время, обнуляется ECU и соответственно параметры на топливно-воздушную смесь которые он так долго собирал до того как его обнулили. Соответственно компу требуется какое-то время, чтобы эти параметры заново собрать и установить как оптимальные. Другой вопрос что это не должно проявляться таким фатальным образом как у тебя, надо бы продиагностироваться, возможно кое-что из фильтров, датчиков требует замены.